1月27日,中國海洋大學(xué)海洋生命學(xué)院、深海圈層與地球系統(tǒng)前沿科學(xué)中心張玉忠教授團(tuán)隊(duì)在Nature旗下國際生態(tài)學(xué)主流期刊TheISMEJournal在線發(fā)表題為“Ubiquitous occurrence of a dimethylsulfoniopropionate ABC transporter in abundant marine bacteria”(海洋細(xì)菌中普遍存在的ABC型DMSP轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng))的研究論文。海洋生命學(xué)院李春陽教授、英國華威大學(xué)MichaelaA.Mausz博士、AndrewMurphy博士和齊魯工業(yè)大學(xué)張楠博士為并列第一作者,海洋生命學(xué)院張玉忠教授、李春陽教授和綠卡特聘教授陳銀教授為共同通訊作者,中國海洋大學(xué)為第一完成單位和通訊作者單位。
二甲基巰基丙酸內(nèi)鹽(Dimethylsulfoniopropionate,DMSP)是海洋環(huán)境中普遍存在的一種有機(jī)硫化合物,在海洋微生物中發(fā)揮重要的生理功能,也是全球碳、硫循環(huán)的重要載體物質(zhì)。SAR11細(xì)菌和海洋玫瑰桿菌類群(MRG)是表層海水中分布最廣的兩大細(xì)菌類群,它們能高效吸收海水中納摩爾量級的DMSP并在胞內(nèi)將DMSP濃度積累到毫摩爾量級。然而,SAR11和MRG類群細(xì)菌如何吸收海水中的DMSP到胞內(nèi)尚不清楚。
本研究綜合運(yùn)用比較基因組學(xué)分析、遺傳學(xué)及生物化學(xué)分析手段,從MRG類群細(xì)菌的代表性菌株RuegeriapomeroyiDSS-3中鑒定出一種特異性轉(zhuǎn)運(yùn)DMSP的ATP結(jié)合盒式轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)DmpXWV,生理與遺傳學(xué)分析表明該轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)是菌株DSS-3吸收DMSP的重要轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)。DmpX為該轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)中的底物結(jié)合蛋白,對DMSP具有很高的親和力和底物特異性;通過結(jié)構(gòu)與生化分析揭示了DmpX識別結(jié)合DMSP的分子機(jī)制。生物信息學(xué)分析表明,DmpX蛋白廣泛分布于包括SAR11和MRG細(xì)菌類群在內(nèi)的很多海洋細(xì)菌中;在全球海洋中,dmpX基因的轉(zhuǎn)錄水平也很高,這表明很多海洋細(xì)菌可以利用該轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)高效富集海水中的DMSP。本研究有助于理解海洋細(xì)菌驅(qū)動有機(jī)硫循環(huán)的過程及其對環(huán)境的適應(yīng)機(jī)制。
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